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vw253
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    v4 v5  
    3434more GO_complexes_one | sort |uniq >GO_complexes_uniq
    3535
     36Remove complexes which are more specifically annotated or greouping terms
    3637
     38create_GO_complexes_list$ cat GO_complexes_uniq  | grep -v GO:0005761 | grep -v GO:0031248 | grep -v GO:0031248 | grep -v GO:0034708 | grep -v GO:0043601 | grep -v GO:0055029 | grep -v GO:0005871 | grep -v GO:0005875 | grep -v GO:0008012 | grep -v GO:0017053 | grep -v GO:31248 | grep -v GO:0008012 | grep -v GO:0005874 | grep -v GO:0033202 | grep -v GO:0005667 | grep -v GO:0016585 | grep -v GO:0000123 | grep -v GO:0000118 | grep -v GO:0000152 | grep -v GO:0031461 | grep -v GO:0008287 | grep -v GO:0030530 | grep -v GO:0000445 | grep -v GO:0042788 |grep -v GO:0005844 | grep -v GO:0035770 |grep -v GO:0016471| grep -v GO:0000782| grep -v GO:0000777  | grep -v "GO:0043234" | grep -v GO:0032991 | grep -v "GO:0030529" | grep -v "GO:0000178" | grep -v "GO:0000313" | grep -v GO:0000151 | grep -v GO:0000314  | grep -v GO:0000315 | grep -v  GO:0000776| grep -v GO:0005840 | grep -v GO:0015934  | grep -v GO:0015935 | grep -v  GO:0016459 | grep -v GO:0016469 | grep -v GO:0030117 | grep -v GO:0030120| grep -v GO0030532 | grep -v GO:0030681 | grep -v GO:0031414 | grep -v GO:0032993 | grep -v GO:0033177 | grep -v GO:0033178 | grep -v GO:0034702 | grep -v GO:0043235 | grep -v GO:0044391  | grep -v GO:0045259 | grep -v GO:0045263  | grep -v GO:0045271 | grep -v GO:0045274| grep -v GO:0045282 | grep -v GO:0046930 | grep -v GO:0070461 |grep -v GO:1990351 | grep -v GO:1990391 | grep -v GO:1990234 | grep -v GO:1990204 | grep -v GO:1902911 |grep -v GO:1990104 | grep -v GO:0005677 | grep -v GO:1902494 | grep -v GO:0005732 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0005721 | grep -v GO:0008278 | grep -v GO:0030532| grep -v GO:0070069 | grep -v GO:1902495 | grep -v GO:1902554 | grep -v  GO:0044798 | grep -v GO:0031618 | grep -v GO:0000775 | grep -v GO:0044798  cat GO_complexes_uniq  | grep -v GO:0005761 | grep -v GO:0031248 | grep -v GO:0031248 | grep -v GO:0034708 | grep -v GO:0043601 | grep -v GO:0055029 | grep -v GO:0005871 | grep -v GO:0005875 | grep -v GO:0008012 | grep -v GO:0017053 | grep -v GO:31248 | grep -v GO:0008012 | grep -v GO:0005874 | grep -v GO:0033202 | grep -v GO:0005667 | grep -v GO:0016585 | grep -v GO:0000123 | grep -v GO:0000118 | grep -v GO:0000152 | grep -v GO:0031461 | grep -v GO:0008287 | grep -v GO:0030530 | grep -v GO:0000445 | grep -v GO:0042788 |grep -v GO:0005844 | grep -v GO:0035770 |grep -v GO:0016471| grep -v GO:0000782| grep -v GO:0000777  | grep -v "GO:0043234" | grep -v GO:0032991 | grep -v "GO:0030529" | grep -v "GO:0000178" | grep -v "GO:0000313" | grep -v GO:0000151 | grep -v GO:0000314  | grep -v GO:0000315 | grep -v  GO:0000776| grep -v GO:0005840 | grep -v GO:0015934  | grep -v GO:0015935 | grep -v  GO:0016459 | grep -v GO:0016469 | grep -v GO:0030117 | grep -v GO:0030120| grep -v GO0030532 | grep -v GO:0030681 | grep -v GO:0031414 | grep -v GO:0032993 | grep -v GO:0033177 | grep -v GO:0033178 | grep -v GO:0034702 | grep -v GO:0043235 | grep -v GO:0044391  | grep -v GO:0045259 | grep -v GO:0045263  | grep -v GO:0045271 | grep -v GO:0045274| grep -v GO:0045282 | grep -v GO:0046930 | grep -v GO:0070461 |grep -v GO:1990351 | grep -v GO:1990391 | grep -v GO:1990234 | grep -v GO:1990204 | grep -v GO:1902911 |grep -v GO:1990104 | grep -v GO:0005677 | grep -v GO:1902494 | grep -v GO:0005732 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0000796 | grep -v GO:0005721 | grep -v GO:0008278 | grep -v GO:0030532| grep -v GO:0070069 | grep -v GO:1902495 | grep -v GO:1902554 | grep -v  GO:0044798 | grep -v GO:0031618 | grep -v GO:0000775 | grep -v GO:0044798 
     39
     40
     41next still need to checkremove a few more after annotations fixes
     42remove RNAs
     43
     44
     45
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